Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.649e-9■■■□□ 16.8
APOBEC3CQ9NRW3 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.789e-9■■■□□ 16.8
APOBEC3CQ9NRW3 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.99e-9■■■□□ 16.8
APOBEC3CQ9NRW3 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.189e-9■■■□□ 16.8
APOBEC3CQ9NRW3 BCAT1-207ENST00000543099 568 ntTSL 43.04□□□□□ -1.929e-9■■■□□ 16.8
APOBEC3CQ9NRW3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 16.8
APOBEC3CQ9NRW3 EMD-205ENST00000471965 800 ntTSL 223.89■■□□□ 1.411e-17■■■□□ 16.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.821e-17■■■□□ 16.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.691e-17■■■□□ 16.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 318.91■□□□□ 0.621e-17■■■□□ 16.7
APOBEC3CQ9NRW3 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 218.09■□□□□ 0.491e-17■■■□□ 16.7
APOBEC3CQ9NRW3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.537e-8■■■□□ 16.7
APOBEC3CQ9NRW3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.427e-8■■■□□ 16.7
APOBEC3CQ9NRW3 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 217.11■□□□□ 0.337e-8■■■□□ 16.7
APOBEC3CQ9NRW3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.237e-8■■■□□ 16.7
APOBEC3CQ9NRW3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-7■■■□□ 16.6
APOBEC3CQ9NRW3 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-7■■■□□ 16.6
APOBEC3CQ9NRW3 LRPPRC-206ENST00000463456 3549 ntTSL 24.54□□□□□ -1.682e-7■■■□□ 16.6
APOBEC3CQ9NRW3 LRPPRC-204ENST00000419884 888 ntTSL 54.12□□□□□ -1.752e-7■■■□□ 16.6
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA3-202ENST00000434494 2107 ntTSL 214.62□□□□□ -0.072e-8■■■□□ 16.6
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA3-201ENST00000300289 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-8■■■□□ 16.6
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA3-206ENST00000497349 739 ntTSL 24.04□□□□□ -1.762e-8■■■□□ 16.6
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.662e-6■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.211e-8■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 ARHGAP4-224ENST00000494813 1939 ntTSL 521.3■■□□□ 11e-8■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 NAA10-207ENST00000460996 908 ntTSL 219.6■□□□□ 0.731e-8■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 NAA10-209ENST00000466877 1080 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.661e-8■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 NAA10-214ENST00000482485 1075 ntTSL 217.01■□□□□ 0.311e-8■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.311e-8■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.311e-8■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 NAA10-215ENST00000484950 873 ntTSL 216.07■□□□□ 0.161e-8■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.171e-8■■■□□ 16.5
APOBEC3CQ9NRW3 UBXN1-216ENST00000533908 739 ntTSL 1 (best)19.98■□□□□ 0.793e-6■■■□□ 16.4
APOBEC3CQ9NRW3 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.013e-12■■■□□ 16.4
APOBEC3CQ9NRW3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-8■■■□□ 16.4
APOBEC3CQ9NRW3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-12■■■□□ 16.4
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-205ENST00000548117 499 ntTSL 212.65□□□□□ -0.383e-9■■■□□ 16.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-24■■■□□ 16.4
APOBEC3CQ9NRW3 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.053e-24■■■□□ 16.4
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-217ENST00000591358 3743 nt13.17□□□□□ -0.39e-7■■■□□ 16.3
APOBEC3CQ9NRW3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.833e-8■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 328.31■■■□□ 2.126e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 327.58■■■□□ 2.016e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.856e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.516e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.376e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.176e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.176e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 320.2■□□□□ 0.826e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.426e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.236e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 313.6□□□□□ -0.236e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-216ENST00000555199 230 ntTSL 211.35□□□□□ -0.594e-9■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.044e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-217ENST00000540382 1677 ntTSL 527.02■■□□□ 1.924e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.864e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-219ENST00000542099 1119 ntTSL 325.91■■□□□ 1.744e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-218ENST00000540708 1782 ntTSL 225.55■■□□□ 1.684e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-209ENST00000442210 716 ntTSL 324.46■■□□□ 1.514e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.54e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-216ENST00000539770 1295 ntTSL 1 (best)24.28■■□□□ 1.484e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.424e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-214ENST00000536502 1273 ntTSL 223.06■■□□□ 1.284e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.234e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.224e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.074e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.954e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-215ENST00000539576 1684 ntTSL 519.92■□□□□ 0.784e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-203ENST00000392433 1370 ntTSL 219.74■□□□□ 0.754e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.74e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-212ENST00000456762 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.79■□□□□ 0.64e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.364e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.354e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.334e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.334e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.114e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EPHB4-206ENST00000487222 5058 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.094e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.094e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-206ENST00000413381 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.35□□□□□ -0.114e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.244e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 PTGES3-206ENST00000537473 2939 ntTSL 213.23□□□□□ -0.294e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ZFC3H1-212ENST00000552994 7597 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.464e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ARL6IP4-202ENST00000357866 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.494e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.64e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.767e-6■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)7.33□□□□□ -1.247e-6■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)7.15□□□□□ -1.277e-6■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.367e-6■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 55.6□□□□□ -1.517e-6■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 53.99□□□□□ -1.777e-6■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 ZFC3H1-209ENST00000550963 845 ntTSL 53.87□□□□□ -1.794e-7■■■□□ 16.2
APOBEC3CQ9NRW3 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.437e-15■■■□□ 16.1
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 214.1 ms