RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540382.5

ARL6IP4-217, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene ARL6IP4, Length 1,677 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ARL6IP4-217ENST00000540382 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.38■■■■■ 5.5
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ARL6IP4-217ENST00000540382 SMARCA2P51531 1590 aa45.67■■■■■ 4.9
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ARL6IP4-217ENST00000540382 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.12■■■■■ 4.65
ARL6IP4-217ENST00000540382 NESP48681 1621 aa44.06■■■■■ 4.64
ARL6IP4-217ENST00000540382 PRDM2Q13029 1718 aa43.96■■■■■ 4.63
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ARL6IP4-217ENST00000540382 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.58■■■■■ 4.57
ARL6IP4-217ENST00000540382 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.55■■■■■ 4.56
ARL6IP4-217ENST00000540382 ERCC6Q03468 1493 aa43.47■■■■■ 4.55
ARL6IP4-217ENST00000540382 ABCC8Q09428 1581 aa43.43■■■■■ 4.54
ARL6IP4-217ENST00000540382 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.34■■■■■ 4.53
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ARL6IP4-217ENST00000540382 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.26■■■■■ 4.52
ARL6IP4-217ENST00000540382 CUX1P39880 1505 aa43.21■■■■■ 4.51
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ARL6IP4-217ENST00000540382 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.13■■■■■ 4.49
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ARL6IP4-217ENST00000540382 KIF27Q86VH2 1401 aa42.36■■■■■ 4.37
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ARL6IP4-217ENST00000540382 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.5■■■■■ 4.23
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