Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLE4Q9NR33 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLE4Q9NR33 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLE4Q9NR33 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms