Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH19Q9H159 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH19Q9H159 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH19Q9H159 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH19Q9H159 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms