Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF3Q9BXJ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF3Q9BXJ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF3Q9BXJ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF3Q9BXJ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF3Q9BXJ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 544.6 ms