Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPS4Q9BT78 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPS4Q9BT78 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPS4Q9BT78 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms