Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFD1Q92890 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UFD1Q92890 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFD1Q92890 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UFD1Q92890 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UFD1Q92890 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms