Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC112Q8NEF3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC112Q8NEF3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC112Q8NEF3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC112Q8NEF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC112Q8NEF3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms