Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SETD9Q8NE22 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SETD9Q8NE22 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD9Q8NE22 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD9Q8NE22 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD9Q8NE22 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms