Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00528Q8N1L1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00528Q8N1L1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00528Q8N1L1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms