Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXB2

UBE2NL, Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NLQ5JXB2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2NLQ5JXB2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2NLQ5JXB2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NLQ5JXB2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NLQ5JXB2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NLQ5JXB2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2NLQ5JXB2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2NLQ5JXB2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2NLQ5JXB2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2NLQ5JXB2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.33■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2NLQ5JXB2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.2 ms