Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 SSUH2-204ENST00000415132 1645 ntTSL 522.33■■□□□ 1.173e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 13e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 PCSK6-208ENST00000559417 1035 ntTSL 520.31■□□□□ 0.843e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 SSUH2-201ENST00000317371 2561 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 SSUH2-207ENST00000435138 2632 ntTSL 213.97□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 SSUH2-208ENST00000455157 3219 ntTSL 212.98□□□□□ -0.333e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 SSUH2-210ENST00000466215 492 ntTSL 312.31□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 CHD6-205ENST00000440697 1635 ntTSL 59.27□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.213e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 TARBP1-206ENST00000481183 535 ntTSL 36.9□□□□□ -1.33e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.52e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 TPTEP1-202ENST00000400593 1430 ntTSL 1 (best)18.23■□□□□ 0.512e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.651e-7■□□□□ 11
SAFBQ15424 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 11
SAFBQ15424 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■□□□□ 11
SAFBQ15424 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-7■□□□□ 11
SAFBQ15424 LRRFIP1-212ENST00000483443 1069 ntTSL 314.19□□□□□ -0.141e-7■□□□□ 11
SAFBQ15424 TSSC2-206ENST00000533775 1210 ntTSL 521.5■■□□□ 1.031e-8■□□□□ 11
SAFBQ15424 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-8■□□□□ 11
SAFBQ15424 TSSC2-202ENST00000526284 1244 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.341e-8■□□□□ 11
SAFBQ15424 TSSC2-203ENST00000526488 674 ntTSL 313.41□□□□□ -0.261e-8■□□□□ 11
SAFBQ15424 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 EMC3-AS1-201ENST00000326237 2882 ntTSL 211.93□□□□□ -0.54e-6■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 EMC3-AS1-204ENST00000430621 683 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.044e-6■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.824e-6■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.555e-6■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.915e-7■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.745e-7■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.535e-7■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 RAB17-202ENST00000392001 1792 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.455e-7■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 217.57■□□□□ 0.45e-7■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 RAB17-205ENST00000411462 663 ntTSL 216.92■□□□□ 0.35e-7■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 RAB17-208ENST00000430445 421 ntTSL 515.06■□□□□ 05e-7■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.684e-6■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 ANK1-210ENST00000521407 498 ntTSL 513.19□□□□□ -0.34e-6■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.224e-6■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.434e-6■□□□□ 10.9
SAFBQ15424 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 325.08■■□□□ 1.615e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 218.44■□□□□ 0.545e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 TRIM65-203ENST00000540812 385 ntTSL 217.95■□□□□ 0.465e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.445e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 PNPLA3-202ENST00000406117 1480 ntTSL 217.14■□□□□ 0.335e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.35e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.285e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 RAB17-210ENST00000477149 3211 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.027e-10■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 RAPGEF5-204ENST00000420196 660 ntTSL 513.37□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 PNPLA3-205ENST00000497129 422 ntTSL 513□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.585e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 RAPGEF5-206ENST00000458533 869 ntTSL 59.99□□□□□ -0.815e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.845e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 RAPGEF5-205ENST00000451559 836 ntTSL 59.23□□□□□ -0.935e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 EHBP1-213ENST00000462441 332 ntTSL 33.66□□□□□ -1.825e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.373e-8■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.043e-8■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 10.8
SAFBQ15424 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.628e-7■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.388e-7■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.13e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.456e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 GAB3-201ENST00000369568 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.73□□□□□ -0.051e-8■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 GAB3-202ENST00000369575 4718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-8■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 GAB3-206ENST00000496390 4240 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.321e-8■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 GARS-205ENST00000470392 469 ntTSL 54.05□□□□□ -1.766e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 GARS-202ENST00000444666 619 ntTSL 33.53□□□□□ -1.846e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.656e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.726e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.876e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.886e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.96e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.936e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.016e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.016e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.026e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.026e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.046e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 CD46-211ENST00000464082 567 ntTSL 25.89□□□□□ -1.476e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.641e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.61e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.551e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 230.82■■■□□ 2.521e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.321e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 322.01■■□□□ 1.111e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-244ENST00000495463 501 ntTSL 432.34■■■□□ 2.779e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-234ENST00000475474 749 ntTSL 229.4■■■□□ 2.39e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-238ENST00000482304 740 ntTSL 228.43■■■□□ 2.149e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-227ENST00000462147 576 ntTSL 427.67■■■□□ 2.029e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.869e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-229ENST00000466211 584 ntTSL 325.57■■□□□ 1.689e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-216ENST00000434955 480 ntTSL 325.52■■□□□ 1.689e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-209ENST00000411484 561 ntTSL 424.58■■□□□ 1.539e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-217ENST00000436795 775 ntTSL 524.45■■□□□ 1.59e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-243ENST00000494824 565 ntTSL 523.82■■□□□ 1.49e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-231ENST00000469175 486 ntTSL 323.51■■□□□ 1.359e-6■□□□□ 10.7
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