RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495463.5

SEPT2-244, Transcript of septin 2, humanhuman

TSL 4

Gene SEPT2, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT2-244ENST00000495463 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.96■■■■■ 8.47
SEPT2-244ENST00000495463 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.27■■■■■ 7.24
SEPT2-244ENST00000495463 ABCC9O60706 1549 aa58.39■■■■■ 6.94
SEPT2-244ENST00000495463 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.71■■■■■ 6.67
SEPT2-244ENST00000495463 NACADO15069 1562 aa56.53■■■■■ 6.64
SEPT2-244ENST00000495463 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.52■■■■■ 6.64
SEPT2-244ENST00000495463 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.46■■■■■ 6.63
SEPT2-244ENST00000495463 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.36■■■■■ 6.61
SEPT2-244ENST00000495463 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.29■■■■■ 6.6
SEPT2-244ENST00000495463 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.2■■■■■ 6.43
SEPT2-244ENST00000495463 SCRIBQ14160 1630 aa54.96■■■■■ 6.39
SEPT2-244ENST00000495463 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.69■■■■■ 6.35
SEPT2-244ENST00000495463 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.61■■■■■ 6.33
SEPT2-244ENST00000495463 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.23■■■■■ 6.27
SEPT2-244ENST00000495463 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.22■■■■■ 6.11
SEPT2-244ENST00000495463 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.07■■■■■ 6.09
SEPT2-244ENST00000495463 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.88■■■■■ 6.06
SEPT2-244ENST00000495463 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.83■■■■■ 6.05
SEPT2-244ENST00000495463 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.67■■■■■ 6.02
SEPT2-244ENST00000495463 SMARCA4P51532 1647 aa52.65■■■■■ 6.02
SEPT2-244ENST00000495463 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.35■■■■■ 5.97
SEPT2-244ENST00000495463 SMARCA2P51531 1590 aa52.21■■■■■ 5.95
SEPT2-244ENST00000495463 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.2■■■■■ 5.95
SEPT2-244ENST00000495463 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.13■■■■■ 5.94
SEPT2-244ENST00000495463 NCAPD3P42695 1498 aa52.12■■■■■ 5.93
SEPT2-244ENST00000495463 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.94■■■■■ 5.91
SEPT2-244ENST00000495463 HMGXB3Q12766 1538 aa51.94■■■■■ 5.9
SEPT2-244ENST00000495463 WIZO95785 1651 aa51.84■■■■■ 5.89
SEPT2-244ENST00000495463 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.82■■■■■ 5.89
SEPT2-244ENST00000495463 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.34■■■■■ 5.81
SEPT2-244ENST00000495463 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.97■■■■■ 5.75
SEPT2-244ENST00000495463 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.7■■■■■ 5.71
SEPT2-244ENST00000495463 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.69■■■■■ 5.71
SEPT2-244ENST00000495463 NESP48681 1621 aa50.66■■■■■ 5.7
SEPT2-244ENST00000495463 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.61■■■■■ 5.69
SEPT2-244ENST00000495463 CFTRP13569 1480 aa50.42■■■■■ 5.66
SEPT2-244ENST00000495463 ERCC6Q03468 1493 aa50.33■■■■■ 5.65
SEPT2-244ENST00000495463 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.32■■■■■ 5.65
SEPT2-244ENST00000495463 PRDM2Q13029 1718 aa50.19■■■■■ 5.62
SEPT2-244ENST00000495463 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.16■■■■■ 5.62
SEPT2-244ENST00000495463 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.03■■■■■ 5.6
SEPT2-244ENST00000495463 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.95■■■■■ 5.59
SEPT2-244ENST00000495463 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.84■■■■■ 5.57
SEPT2-244ENST00000495463 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.76■■■■■ 5.56
SEPT2-244ENST00000495463 CUX2O14529 1486 aa49.64■■■■■ 5.54
SEPT2-244ENST00000495463 WDR62O43379 1518 aa49.59■■■■■ 5.53
SEPT2-244ENST00000495463 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.49■■■■■ 5.51
SEPT2-244ENST00000495463 ABCC8Q09428 1581 aa49.37■■■■■ 5.49
SEPT2-244ENST00000495463 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.31■■■■■ 5.48
SEPT2-244ENST00000495463 TOPBP1Q92547 1522 aa49.29■■■■■ 5.48
SEPT2-244ENST00000495463 CUX1P39880 1505 aa49.09■■■■■ 5.45
SEPT2-244ENST00000495463 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.98■■■■■ 5.432e-7■■■■■ 50.1
SEPT2-244ENST00000495463 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.9■■■■■ 5.42
SEPT2-244ENST00000495463 IFT140Q96RY7 1462 aa48.88■■■■■ 5.42
SEPT2-244ENST00000495463 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.86■■■■■ 5.41
SEPT2-244ENST00000495463 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.86■■■■■ 5.41
SEPT2-244ENST00000495463 TOP2BQ02880 1626 aa48.84■■■■■ 5.41
SEPT2-244ENST00000495463 SYNJ1O43426 1573 aa48.82■■■■■ 5.41
SEPT2-244ENST00000495463 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
SEPT2-244ENST00000495463 SOGA1O94964 1423 aa48.71■■■■■ 5.39
SEPT2-244ENST00000495463 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.66■■■■■ 5.38
SEPT2-244ENST00000495463 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.56■■■■■ 5.36
SEPT2-244ENST00000495463 WDR97A6NE52 1622 aa48.48■■■■■ 5.35
SEPT2-244ENST00000495463 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.44■■■■■ 5.35
SEPT2-244ENST00000495463 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.42■■■■■ 5.34
SEPT2-244ENST00000495463 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.35■■■■■ 5.333e-12■■■■■ 53.7
SEPT2-244ENST00000495463 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
SEPT2-244ENST00000495463 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.21■■■■■ 5.31
SEPT2-244ENST00000495463 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.17■■■■■ 5.3
SEPT2-244ENST00000495463 TRIM41Q8WV44 630 aa48.16■■■■■ 5.3
SEPT2-244ENST00000495463 GRIN2BQ13224 1484 aa48.1■■■■■ 5.29
SEPT2-244ENST00000495463 PBRM1Q86U86 1689 aa48.08■■■■■ 5.29
SEPT2-244ENST00000495463 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.95■■■■■ 5.27
SEPT2-244ENST00000495463 KIF27Q86VH2 1401 aa47.94■■■■■ 5.26
SEPT2-244ENST00000495463 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.94■■■■■ 5.26
SEPT2-244ENST00000495463 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.88■■■■■ 5.26
SEPT2-244ENST00000495463 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.87■■■■■ 5.25
SEPT2-244ENST00000495463 CHD1O14646 1710 aa47.77■■■■■ 5.24
SEPT2-244ENST00000495463 SYNJ2O15056 1496 aa47.73■■■■■ 5.23
SEPT2-244ENST00000495463 ADAMTS12P58397 1594 aa47.71■■■■■ 5.23
SEPT2-244ENST00000495463 FBLN2P98095 1184 aa47.68■■■■■ 5.22
SEPT2-244ENST00000495463 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
SEPT2-244ENST00000495463 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.64■■■■■ 5.22
SEPT2-244ENST00000495463 IGF1RP08069 1367 aa47.64■■■■■ 5.22
SEPT2-244ENST00000495463 OSCARQ8IYS5 282 aa47.64■■■■■ 5.22
SEPT2-244ENST00000495463 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.58■■■■■ 5.21
SEPT2-244ENST00000495463 CUL7Q14999 1698 aa47.57■■■■■ 5.21
SEPT2-244ENST00000495463 GRIN2AQ12879 1464 aa47.47■■■■■ 5.19
SEPT2-244ENST00000495463 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.47■■■■■ 5.19
SEPT2-244ENST00000495463 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.39■■■■■ 5.18
SEPT2-244ENST00000495463 EEA1Q15075 1411 aa47.38■■■■■ 5.17
SEPT2-244ENST00000495463 NUP160Q12769 1436 aa47.24■■■■■ 5.15
SEPT2-244ENST00000495463 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.23■■■■■ 5.15
SEPT2-244ENST00000495463 CEP170Q5SW79 1584 aa47.21■■■■■ 5.15
SEPT2-244ENST00000495463 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.19■■■■■ 5.14
SEPT2-244ENST00000495463 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.18■■■■■ 5.14
SEPT2-244ENST00000495463 PRXQ9BXM0 1461 aa47.12■■■■■ 5.13
SEPT2-244ENST00000495463 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.09■■■■■ 5.13
SEPT2-244ENST00000495463 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.93■■■■■ 5.1
SEPT2-244ENST00000495463 ARHGEF11O15085 1522 aa46.87■■■■■ 5.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms