Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 HNRNPM-212ENST00000598999 409 ntTSL 220.03■□□□□ 0.87e-11■■■■□ 23
G3BP1Q13283 WWP2-208ENST00000567161 698 ntTSL 219.99■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 MCM5-208ENST00000465557 587 ntTSL 419.39■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 WWP2-207ENST00000566463 1971 ntTSL 218.01■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DPP3-201ENST00000525738 463 ntTSL 317.41■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 VPS11-205ENST00000534551 585 ntTSL 317.37■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 WWP2-217ENST00000569297 2462 ntTSL 216.89■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 NUP188-206ENST00000485158 392 ntTSL 216.84■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DIABLO-202ENST00000342392 1336 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.227e-7■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DKC1-210ENST00000481062 819 ntTSL 216.01■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DIABLO-214ENST00000541273 555 ntTSL 215.9■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 SMS-204ENST00000478094 488 ntTSL 414.44□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.117e-7■■■■□ 23
G3BP1Q13283 AC022384.1-201ENST00000437082 2270 ntAPPRIS P5 TSL 213.57□□□□□ -0.241e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DIABLO-205ENST00000439489 634 ntTSL 312.98□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 VPS11-208ENST00000621676 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 TTC27-201ENST00000317907 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 WWP2-203ENST00000544162 2723 ntTSL 212.69□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 TATDN2-203ENST00000448281 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DKC1-209ENST00000475966 902 ntTSL 512.39□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 UMPS-207ENST00000487622 799 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DKC1-204ENST00000426673 843 ntTSL 511.84□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 VPS11-207ENST00000620429 2739 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 TTC27-203ENST00000433416 660 ntTSL 311.53□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DIABLO-213ENST00000540535 703 ntTSL 310.36□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 UMPS-208ENST00000495751 558 ntTSL 310.17□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 VPS11-209ENST00000622309 3352 ntTSL 58.8□□□□□ -11e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 DIABLO-209ENST00000474004 804 ntTSL 28.26□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.612e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 XPO5-210ENST00000496341 800 ntTSL 52.89□□□□□ -1.952e-6■■■■□ 23
G3BP1Q13283 CPS1-205ENST00000467353 323 ntTSL 35.08□□□□□ -1.63e-6■■■■□ 22.9
G3BP1Q13283 CCT2-211ENST00000550653 567 ntTSL 26.28□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 22.9
G3BP1Q13283 MLF2-208ENST00000541305 564 ntTSL 222.64■■□□□ 1.213e-8■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.893e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.072e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 HACD3-204ENST00000562832 789 ntTSL 54.32□□□□□ -1.722e-6■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.197e-7■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.337e-7■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.487e-7■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.697e-7■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.697e-7■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.064e-7■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 PSMD2-216ENST00000488085 543 ntTSL 410.89□□□□□ -0.675e-10■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.538e-8■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)22.21■■□□□ 1.158e-8■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 420.34■□□□□ 0.858e-8■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.348e-8■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.048e-8■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.058e-8■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.088e-8■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 38.16□□□□□ -1.18e-8■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 UGDH-212ENST00000515398 584 ntTSL 519.77■□□□□ 0.763e-16■■■■□ 22.8
G3BP1Q13283 PABPC1-218ENST00000521865 628 ntTSL 225.74■■□□□ 1.719e-14■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 MRPS27-213ENST00000522404 550 ntTSL 416.07■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 CRNKL1-204ENST00000490910 4183 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.293e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 MRPS27-211ENST00000522042 578 ntTSL 411.98□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 MRPS27-207ENST00000515404 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 MRPS27-214ENST00000522562 832 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 CRNKL1-205ENST00000496549 4093 ntTSL 1 (best)9.12□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.963e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 MRPS27-208ENST00000519143 298 ntTSL 50.64□□□□□ -2.313e-6■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-213ENST00000555944 2588 ntTSL 221.43■■□□□ 1.024e-7■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.94e-7■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.884e-7■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.684e-7■■■■□ 22.7
G3BP1Q13283 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-8■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 PHGDH-203ENST00000462324 767 ntTSL 516.31■□□□□ 0.28e-8■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 PHGDH-220ENST00000641570 1036 nt16.07■□□□□ 0.168e-8■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 PHGDH-218ENST00000641491 986 nt16.07■□□□□ 0.168e-8■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 PHGDH-222ENST00000641587 566 nt12.25□□□□□ -0.458e-8■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 PHGDH-212ENST00000641247 710 nt11.82□□□□□ -0.528e-8■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 PHGDH-206ENST00000493622 742 ntTSL 510.99□□□□□ -0.658e-8■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.215e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 COG4-201ENST00000323786 2833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.275e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 COG4-203ENST00000482252 2953 ntTSL 213.36□□□□□ -0.275e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 COG4-211ENST00000564415 3000 ntTSL 513.08□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 COG4-207ENST00000530314 3488 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.525e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 22.6
G3BP1Q13283 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 22.6
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