Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP1Q04837 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP1Q04837 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SSBP1Q04837 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms