Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPEQ02224 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPEQ02224 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPEQ02224 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms