Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4BP68371 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4BP68371 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB4BP68371 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4BP68371 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms