Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS3AP61247 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS3AP61247 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS3AP61247 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms