Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRLP54845 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRLP54845 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRLP54845 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRLP54845 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRLP54845 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRLP54845 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRLP54845 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRLP54845 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRLP54845 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRLP54845 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRLP54845 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRLP54845 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRLP54845 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRLP54845 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRLP54845 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NRLP54845 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRLP54845 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRLP54845 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRLP54845 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRLP54845 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRLP54845 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRLP54845 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRLP54845 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRLP54845 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NRLP54845 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRLP54845 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRLP54845 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRLP54845 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRLP54845 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRLP54845 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRLP54845 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRLP54845 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRLP54845 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRLP54845 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NRLP54845 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRLP54845 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRLP54845 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRLP54845 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRLP54845 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRLP54845 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRLP54845 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRLP54845 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRLP54845 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRLP54845 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRLP54845 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRLP54845 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRLP54845 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRLP54845 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRLP54845 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRLP54845 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRLP54845 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRLP54845 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRLP54845 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRLP54845 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRLP54845 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRLP54845 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRLP54845 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRLP54845 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRLP54845 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRLP54845 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRLP54845 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRLP54845 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRLP54845 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRLP54845 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRLP54845 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRLP54845 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NRLP54845 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRLP54845 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRLP54845 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRLP54845 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRLP54845 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRLP54845 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRLP54845 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NRLP54845 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRLP54845 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRLP54845 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRLP54845 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRLP54845 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRLP54845 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRLP54845 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRLP54845 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRLP54845 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRLP54845 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRLP54845 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRLP54845 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRLP54845 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRLP54845 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NRLP54845 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRLP54845 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms