Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB2P49721 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB2P49721 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms