Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01737 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01737 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01737 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01737 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01737 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01737 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01737 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01737 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01737 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01737 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01737 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01737 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01737 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01737 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01737 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01737 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01737 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01737 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01737 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01737 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01737 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01737 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01737 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01737 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01737 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01737 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01737 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01737 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01737 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01737 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01737 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01737 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01737 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01737 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01737 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01737 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01737 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01737 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01737 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01737 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01737 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01737 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01737 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01737 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01737 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01737 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01737 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01737 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01737 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01737 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01737 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P01737 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01737 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01737 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01737 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01737 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01737 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01737 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01737 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01737 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01737 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01737 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01737 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01737 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01737 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01737 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01737 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01737 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01737 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms