Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 213.75□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 43.3
RBFOX2O43251 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 43.3
RBFOX2O43251 PRKCZ-214ENST00000478770 1542 ntTSL 211.69□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 43.3
RBFOX2O43251 PRKCZ-213ENST00000472017 602 ntTSL 48.95□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 43.3
RBFOX2O43251 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.335e-14■■■■■ 43.2
RBFOX2O43251 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.345e-14■■■■■ 43.2
RBFOX2O43251 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-14■■■■■ 43.2
RBFOX2O43251 TEAD3-203ENST00000433586 657 ntTSL 57.3□□□□□ -1.245e-14■■■■■ 43.2
RBFOX2O43251 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 53.52□□□□□ -1.853e-9■■■■■ 43.1
RBFOX2O43251 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 33.08□□□□□ -1.923e-9■■■■■ 43.1
RBFOX2O43251 PGPEP1-207ENST00000597663 363 ntTSL 312.05□□□□□ -0.485e-11■■■■■ 43.1
RBFOX2O43251 PGPEP1-202ENST00000269919 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.915e-11■■■■■ 43.1
RBFOX2O43251 PGPEP1-204ENST00000595552 418 ntTSL 28.88□□□□□ -0.995e-11■■■■■ 43.1
RBFOX2O43251 PTPRK-209ENST00000415046 1029 ntTSL 53.34□□□□□ -1.872e-7■■■■■ 43.1
RBFOX2O43251 PTPRK-210ENST00000415055 782 ntTSL 53.03□□□□□ -1.922e-7■■■■■ 43.1
RBFOX2O43251 PTPRK-220ENST00000531466 311 ntTSL 52.5□□□□□ -2.012e-7■■■■■ 43.1
RBFOX2O43251 NRBP2-207ENST00000531729 1064 ntTSL 1 (best)18.4■□□□□ 0.541e-12■■■■■ 43
RBFOX2O43251 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 43
RBFOX2O43251 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 43
RBFOX2O43251 UAP1-202ENST00000367924 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 43
RBFOX2O43251 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.44e-8■■■■■ 43
RBFOX2O43251 SRC-206ENST00000472968 461 ntTSL 313.64□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 43
RBFOX2O43251 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 43
RBFOX2O43251 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.797e-8■■■■■ 43
RBFOX2O43251 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.937e-8■■■■■ 43
RBFOX2O43251 ERBB3-219ENST00000551242 2755 ntTSL 1 (best)10.38□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 43
RBFOX2O43251 ERBB3-208ENST00000549205 971 ntTSL 59.88□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 43
RBFOX2O43251 ERBB3-217ENST00000551085 4382 ntTSL 29.76□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 43
RBFOX2O43251 ERBB3-216ENST00000550869 572 ntTSL 49.74□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 43
RBFOX2O43251 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 43
RBFOX2O43251 ERBB3-214ENST00000550070 2729 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 43
RBFOX2O43251 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 43
RBFOX2O43251 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.25e-9■■■■■ 42.9
RBFOX2O43251 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 42.7
RBFOX2O43251 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.194e-12■■■■■ 42.7
RBFOX2O43251 PLXND1-216ENST00000514990 1084 ntTSL 28.94□□□□□ -0.984e-12■■■■■ 42.7
RBFOX2O43251 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 42.7
RBFOX2O43251 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 42.7
RBFOX2O43251 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 42.7
RBFOX2O43251 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 42.6
RBFOX2O43251 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 42.6
RBFOX2O43251 MGAT4B-218ENST00000521855 593 ntTSL 210.51□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 42.6
RBFOX2O43251 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.677e-8■■■■■ 42.5
RBFOX2O43251 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.81e-7■■■■■ 42.5
RBFOX2O43251 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.941e-7■■■■■ 42.5
RBFOX2O43251 HNMT-208ENST00000485653 675 ntTSL 51.63□□□□□ -2.151e-7■■■■■ 42.5
RBFOX2O43251 MPZL1-204ENST00000403379 961 ntTSL 54.78□□□□□ -1.641e-10■■■■■ 42.5
RBFOX2O43251 CPNE7-208ENST00000566398 672 ntTSL 314.6□□□□□ -0.073e-14■■■■■ 42.5
RBFOX2O43251 FARP2-215ENST00000476799 702 ntTSL 211.59□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 42.5
RBFOX2O43251 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 512.51□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 42.5
RBFOX2O43251 RPP40-206ENST00000483546 654 ntTSL 312.3□□□□□ -0.443e-12■■■■■ 42.4
RBFOX2O43251 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.673e-12■■■■■ 42.4
RBFOX2O43251 TRAF2-203ENST00000419057 709 ntTSL 310.4□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 42.4
RBFOX2O43251 TRAF2-204ENST00000429509 823 ntTSL 310.04□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 42.4
RBFOX2O43251 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 213.73□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 42.4
RBFOX2O43251 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 214.86□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 42.3
RBFOX2O43251 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 311.09□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 42.3
RBFOX2O43251 CALM3-213ENST00000602169 590 ntTSL 210.66□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 AC091078.1-205ENST00000553478 578 ntTSL 49.78□□□□□ -0.843e-9■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 AC091078.1-201ENST00000554466 571 ntTSL 48.6□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 AC091078.1-204ENST00000556519 1321 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.053e-9■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 AC091078.1-203ENST00000554105 676 ntTSL 46.09□□□□□ -1.433e-9■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.032e-21■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-21■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.372e-21■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.452e-21■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-21■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 AC068768.1-202ENST00000541002 1110 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.242e-21■■■■■ 42.2
RBFOX2O43251 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.096e-8■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 SLC22A1-204ENST00000460902 1484 ntTSL 514.5□□□□□ -0.096e-8■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.16e-8■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 SLC22A1-206ENST00000539263 1598 ntTSL 513.13□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 MPZL1-205ENST00000448405 1596 ntTSL 1 (best)18.68■□□□□ 0.581e-10■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-10■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-10■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 MPZL1-202ENST00000367853 881 ntTSL 1 (best)6.41□□□□□ -1.381e-10■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 MPZL1-208ENST00000474729 1335 ntTSL 1 (best)5.89□□□□□ -1.471e-10■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 TRAP1-216ENST00000576335 645 ntTSL 59.07□□□□□ -0.963e-12■■■■■ 42.1
RBFOX2O43251 ERI3-205ENST00000457571 975 ntTSL 520.04■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 42
RBFOX2O43251 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 317.89■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 42
RBFOX2O43251 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 42
RBFOX2O43251 ERI3-209ENST00000495828 972 ntTSL 317.02■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 42
RBFOX2O43251 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 42
RBFOX2O43251 KISS1R-202ENST00000592648 507 ntTSL 514.22□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 42
RBFOX2O43251 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 SCAP-202ENST00000320017 3430 ntTSL 212.76□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 SCAP-207ENST00000441517 3748 ntTSL 212.37□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 LMO7-201ENST00000321797 5647 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.126e-8■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.326e-8■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.386e-8■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.436e-8■■■■■ 41.9
RBFOX2O43251 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 41.8
RBFOX2O43251 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 41.8
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 215.5 ms