RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597663.2

PGPEP1-207, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 3

Gene PGPEP1, Length 363 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-207ENST00000597663 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.1■■■■□ 3.69
PGPEP1-207ENST00000597663 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.06■■■■□ 3.04
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PGPEP1-207ENST00000597663 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.06■■■□□ 2.72
PGPEP1-207ENST00000597663 NACADO15069 1562 aa31.96■■■□□ 2.71
PGPEP1-207ENST00000597663 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
PGPEP1-207ENST00000597663 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.74■■■□□ 2.67
PGPEP1-207ENST00000597663 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.71■■■□□ 2.67
PGPEP1-207ENST00000597663 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.54■■■□□ 2.64
PGPEP1-207ENST00000597663 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.44■■■□□ 2.62
PGPEP1-207ENST00000597663 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.07■■■□□ 2.56
PGPEP1-207ENST00000597663 SCRIBQ14160 1630 aa31.02■■■□□ 2.56
PGPEP1-207ENST00000597663 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.555e-7■□□□□ 11.2
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PGPEP1-207ENST00000597663 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.54■■■□□ 2.48
PGPEP1-207ENST00000597663 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
PGPEP1-207ENST00000597663 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.18■■■□□ 2.42
PGPEP1-207ENST00000597663 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.94■■■□□ 2.38
PGPEP1-207ENST00000597663 SMARCA4P51532 1647 aa29.66■■■□□ 2.34
PGPEP1-207ENST00000597663 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PGPEP1-207ENST00000597663 SMARCA2P51531 1590 aa29.47■■■□□ 2.31
PGPEP1-207ENST00000597663 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.43■■■□□ 2.3
PGPEP1-207ENST00000597663 NCAPD3P42695 1498 aa29.42■■■□□ 2.3
PGPEP1-207ENST00000597663 HMGXB3Q12766 1538 aa29.36■■■□□ 2.29
PGPEP1-207ENST00000597663 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.36■■■□□ 2.29
PGPEP1-207ENST00000597663 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.35■■■□□ 2.29
PGPEP1-207ENST00000597663 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
PGPEP1-207ENST00000597663 WIZO95785 1651 aa29.09■■■□□ 2.25
PGPEP1-207ENST00000597663 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PGPEP1-207ENST00000597663 NESP48681 1621 aa28.79■■■□□ 2.2
PGPEP1-207ENST00000597663 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PGPEP1-207ENST00000597663 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.76■■■□□ 2.19
PGPEP1-207ENST00000597663 ERCC6Q03468 1493 aa28.75■■■□□ 2.19
PGPEP1-207ENST00000597663 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.58■■■□□ 2.16
PGPEP1-207ENST00000597663 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.53■■■□□ 2.16
PGPEP1-207ENST00000597663 CUX2O14529 1486 aa28.49■■■□□ 2.15
PGPEP1-207ENST00000597663 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.49■■■□□ 2.15
PGPEP1-207ENST00000597663 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PGPEP1-207ENST00000597663 PRDM2Q13029 1718 aa28.39■■■□□ 2.14
PGPEP1-207ENST00000597663 CFTRP13569 1480 aa28.38■■■□□ 2.13
PGPEP1-207ENST00000597663 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.34■■■□□ 2.13
PGPEP1-207ENST00000597663 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.28■■■□□ 2.12
PGPEP1-207ENST00000597663 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.27■■■□□ 2.12
PGPEP1-207ENST00000597663 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.25■■■□□ 2.11
PGPEP1-207ENST00000597663 WDR62O43379 1518 aa28.19■■■□□ 2.1
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PGPEP1-207ENST00000597663 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
PGPEP1-207ENST00000597663 TOPBP1Q92547 1522 aa27.82■■■□□ 2.04
PGPEP1-207ENST00000597663 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.82■■■□□ 2.04
PGPEP1-207ENST00000597663 ABCC8Q09428 1581 aa27.79■■■□□ 2.04
PGPEP1-207ENST00000597663 IFT140Q96RY7 1462 aa27.66■■■□□ 2.02
PGPEP1-207ENST00000597663 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.62■■■□□ 2.01
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PGPEP1-207ENST00000597663 CUX1P39880 1505 aa27.57■■■□□ 2
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PGPEP1-207ENST00000597663 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PGPEP1-207ENST00000597663 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.49■■□□□ 1.99
PGPEP1-207ENST00000597663 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.41■■□□□ 1.98
PGPEP1-207ENST00000597663 WDR97A6NE52 1622 aa27.39■■□□□ 1.98
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PGPEP1-207ENST00000597663 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.38■■□□□ 1.97
PGPEP1-207ENST00000597663 TOP2BQ02880 1626 aa27.34■■□□□ 1.97
PGPEP1-207ENST00000597663 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.964e-9■■■■■ 58.2
PGPEP1-207ENST00000597663 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
PGPEP1-207ENST00000597663 SYNJ1O43426 1573 aa27.31■■□□□ 1.96
PGPEP1-207ENST00000597663 CHD1O14646 1710 aa27.25■■□□□ 1.95
PGPEP1-207ENST00000597663 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
PGPEP1-207ENST00000597663 PBRM1Q86U86 1689 aa27.23■■□□□ 1.95
PGPEP1-207ENST00000597663 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.21■■□□□ 1.95
PGPEP1-207ENST00000597663 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.19■■□□□ 1.94
PGPEP1-207ENST00000597663 OSCARQ8IYS5 282 aa27.16■■□□□ 1.94
PGPEP1-207ENST00000597663 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.14■■□□□ 1.94
PGPEP1-207ENST00000597663 GRIN2BQ13224 1484 aa27.13■■□□□ 1.93
PGPEP1-207ENST00000597663 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.12■■□□□ 1.93
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PGPEP1-207ENST00000597663 FBLN2P98095 1184 aa26.99■■□□□ 1.91
PGPEP1-207ENST00000597663 SYNJ2O15056 1496 aa26.99■■□□□ 1.91
PGPEP1-207ENST00000597663 ADAMTS12P58397 1594 aa26.94■■□□□ 1.9
PGPEP1-207ENST00000597663 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.91■■□□□ 1.9
PGPEP1-207ENST00000597663 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.91■■□□□ 1.9
PGPEP1-207ENST00000597663 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.91■■□□□ 1.9
PGPEP1-207ENST00000597663 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.9■■□□□ 1.9
PGPEP1-207ENST00000597663 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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PGPEP1-207ENST00000597663 ARHGEF11O15085 1522 aa26.85■■□□□ 1.89
PGPEP1-207ENST00000597663 GRIN2AQ12879 1464 aa26.81■■□□□ 1.88
PGPEP1-207ENST00000597663 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.79■■□□□ 1.88
PGPEP1-207ENST00000597663 KIF27Q86VH2 1401 aa26.74■■□□□ 1.87
PGPEP1-207ENST00000597663 CEP170Q5SW79 1584 aa26.71■■□□□ 1.87
PGPEP1-207ENST00000597663 CUL7Q14999 1698 aa26.71■■□□□ 1.87
PGPEP1-207ENST00000597663 TRIM41Q8WV44 630 aa26.7■■□□□ 1.86
PGPEP1-207ENST00000597663 NUP160Q12769 1436 aa26.67■■□□□ 1.86
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PGPEP1-207ENST00000597663 IGF1RP08069 1367 aa26.58■■□□□ 1.84
PGPEP1-207ENST00000597663 SHROOM2Q13796 1616 aa26.56■■□□□ 1.84
PGPEP1-207ENST00000597663 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.55■■□□□ 1.84
PGPEP1-207ENST00000597663 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.48■■□□□ 1.83
PGPEP1-207ENST00000597663 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.46■■□□□ 1.83
PGPEP1-207ENST00000597663 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.45■■□□□ 1.82
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