Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPLO15194 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPLO15194 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPLO15194 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPLO15194 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPLO15194 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPLO15194 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPLO15194 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPLO15194 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPLO15194 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPLO15194 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPLO15194 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPLO15194 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPLO15194 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPLO15194 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPLO15194 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPLO15194 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPLO15194 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPLO15194 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPLO15194 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPLO15194 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPLO15194 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPLO15194 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPLO15194 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPLO15194 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPLO15194 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPLO15194 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSPLO15194 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPLO15194 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPLO15194 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPLO15194 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPLO15194 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSPLO15194 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPLO15194 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPLO15194 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPLO15194 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPLO15194 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPLO15194 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPLO15194 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPLO15194 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSPLO15194 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTDSPLO15194 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSPLO15194 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms