Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CHD1O14646 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CHD1O14646 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
CHD1O14646 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
CHD1O14646 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
CHD1O14646 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CHD1O14646 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CHD1O14646 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHD1O14646 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHD1O14646 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHD1O14646 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHD1O14646 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CHD1O14646 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CHD1O14646 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CHD1O14646 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CHD1O14646 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
CHD1O14646 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CHD1O14646 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CHD1O14646 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CHD1O14646 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CHD1O14646 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CHD1O14646 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CHD1O14646 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CHD1O14646 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CHD1O14646 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CHD1O14646 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CHD1O14646 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CHD1O14646 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHD1O14646 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHD1O14646 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHD1O14646 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHD1O14646 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CHD1O14646 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CHD1O14646 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CHD1O14646 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CHD1O14646 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
CHD1O14646 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CHD1O14646 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
CHD1O14646 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CHD1O14646 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CHD1O14646 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CHD1O14646 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CHD1O14646 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CHD1O14646 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CHD1O14646 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CHD1O14646 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CHD1O14646 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CHD1O14646 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CHD1O14646 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CHD1O14646 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CHD1O14646 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CHD1O14646 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CHD1O14646 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CHD1O14646 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
CHD1O14646 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CHD1O14646 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CHD1O14646 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CHD1O14646 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
CHD1O14646 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CHD1O14646 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
CHD1O14646 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CHD1O14646 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CHD1O14646 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CHD1O14646 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CHD1O14646 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CHD1O14646 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CHD1O14646 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
CHD1O14646 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHD1O14646 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHD1O14646 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHD1O14646 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHD1O14646 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHD1O14646 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHD1O14646 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHD1O14646 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHD1O14646 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CHD1O14646 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CHD1O14646 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CHD1O14646 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CHD1O14646 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CHD1O14646 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CHD1O14646 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CHD1O14646 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CHD1O14646 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CHD1O14646 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CHD1O14646 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CHD1O14646 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CHD1O14646 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CHD1O14646 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CHD1O14646 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CHD1O14646 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CHD1O14646 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CHD1O14646 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CHD1O14646 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CHD1O14646 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CHD1O14646 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CHD1O14646 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CHD1O14646 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHD1O14646 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHD1O14646 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
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