Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRPO00591 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRPO00591 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRPO00591 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRPO00591 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRPO00591 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRPO00591 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRPO00591 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRPO00591 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRPO00591 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRPO00591 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRPO00591 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRPO00591 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRPO00591 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRPO00591 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRPO00591 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRPO00591 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRPO00591 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GABRPO00591 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRPO00591 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRPO00591 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRPO00591 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRPO00591 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRPO00591 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRPO00591 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRPO00591 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRPO00591 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRPO00591 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRPO00591 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRPO00591 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRPO00591 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRPO00591 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRPO00591 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRPO00591 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRPO00591 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRPO00591 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRPO00591 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRPO00591 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRPO00591 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRPO00591 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRPO00591 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRPO00591 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRPO00591 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRPO00591 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRPO00591 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRPO00591 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRPO00591 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRPO00591 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRPO00591 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRPO00591 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRPO00591 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRPO00591 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRPO00591 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRPO00591 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRPO00591 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRPO00591 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRPO00591 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRPO00591 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRPO00591 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRPO00591 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRPO00591 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRPO00591 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRPO00591 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRPO00591 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRPO00591 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRPO00591 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRPO00591 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRPO00591 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRPO00591 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRPO00591 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRPO00591 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRPO00591 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRPO00591 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRPO00591 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRPO00591 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRPO00591 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRPO00591 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRPO00591 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRPO00591 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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