Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TSR3Q9UJK0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms