Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA64

FN3KRP, Ketosamine-3-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FN3KRPQ9HA64 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FN3KRPQ9HA64 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FN3KRPQ9HA64 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms