Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA64

FN3KRP, Ketosamine-3-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FN3KRPQ9HA64 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FN3KRPQ9HA64 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FN3KRPQ9HA64 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FN3KRPQ9HA64 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FN3KRPQ9HA64 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FN3KRPQ9HA64 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FN3KRPQ9HA64 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FN3KRPQ9HA64 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FN3KRPQ9HA64 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FN3KRPQ9HA64 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FN3KRPQ9HA64 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FN3KRPQ9HA64 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FN3KRPQ9HA64 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FN3KRPQ9HA64 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FN3KRPQ9HA64 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FN3KRPQ9HA64 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FN3KRPQ9HA64 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FN3KRPQ9HA64 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FN3KRPQ9HA64 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FN3KRPQ9HA64 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FN3KRPQ9HA64 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FN3KRPQ9HA64 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FN3KRPQ9HA64 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FN3KRPQ9HA64 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FN3KRPQ9HA64 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FN3KRPQ9HA64 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FN3KRPQ9HA64 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FN3KRPQ9HA64 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FN3KRPQ9HA64 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FN3KRPQ9HA64 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FN3KRPQ9HA64 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FN3KRPQ9HA64 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FN3KRPQ9HA64 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FN3KRPQ9HA64 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FN3KRPQ9HA64 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FN3KRPQ9HA64 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FN3KRPQ9HA64 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FN3KRPQ9HA64 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FN3KRPQ9HA64 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FN3KRPQ9HA64 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FN3KRPQ9HA64 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FN3KRPQ9HA64 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FN3KRPQ9HA64 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FN3KRPQ9HA64 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FN3KRPQ9HA64 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FN3KRPQ9HA64 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FN3KRPQ9HA64 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FN3KRPQ9HA64 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FN3KRPQ9HA64 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FN3KRPQ9HA64 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FN3KRPQ9HA64 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FN3KRPQ9HA64 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FN3KRPQ9HA64 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FN3KRPQ9HA64 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FN3KRPQ9HA64 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FN3KRPQ9HA64 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FN3KRPQ9HA64 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FN3KRPQ9HA64 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FN3KRPQ9HA64 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FN3KRPQ9HA64 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FN3KRPQ9HA64 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FN3KRPQ9HA64 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FN3KRPQ9HA64 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FN3KRPQ9HA64 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FN3KRPQ9HA64 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FN3KRPQ9HA64 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FN3KRPQ9HA64 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FN3KRPQ9HA64 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FN3KRPQ9HA64 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FN3KRPQ9HA64 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FN3KRPQ9HA64 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FN3KRPQ9HA64 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FN3KRPQ9HA64 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FN3KRPQ9HA64 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FN3KRPQ9HA64 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FN3KRPQ9HA64 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FN3KRPQ9HA64 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FN3KRPQ9HA64 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FN3KRPQ9HA64 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FN3KRPQ9HA64 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FN3KRPQ9HA64 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FN3KRPQ9HA64 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FN3KRPQ9HA64 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FN3KRPQ9HA64 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FN3KRPQ9HA64 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FN3KRPQ9HA64 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FN3KRPQ9HA64 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FN3KRPQ9HA64 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FN3KRPQ9HA64 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FN3KRPQ9HA64 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FN3KRPQ9HA64 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms