Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ARPC5O15511 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC5O15511 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms