Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms