Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP1B3P54709 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP1B3P54709 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP1B3P54709 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP1B3P54709 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1B3P54709 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP1B3P54709 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP1B3P54709 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1B3P54709 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP1B3P54709 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP1B3P54709 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP1B3P54709 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1B3P54709 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP1B3P54709 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP1B3P54709 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP1B3P54709 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1B3P54709 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1B3P54709 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1B3P54709 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1B3P54709 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP1B3P54709 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1B3P54709 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP1B3P54709 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP1B3P54709 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP1B3P54709 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP1B3P54709 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1B3P54709 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1B3P54709 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1B3P54709 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP1B3P54709 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP1B3P54709 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP1B3P54709 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP1B3P54709 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATP1B3P54709 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP1B3P54709 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP1B3P54709 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP1B3P54709 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP1B3P54709 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP1B3P54709 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP1B3P54709 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP1B3P54709 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP1B3P54709 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP1B3P54709 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP1B3P54709 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP1B3P54709 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP1B3P54709 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP1B3P54709 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP1B3P54709 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1B3P54709 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP1B3P54709 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1B3P54709 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP1B3P54709 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP1B3P54709 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP1B3P54709 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP1B3P54709 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1B3P54709 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP1B3P54709 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1B3P54709 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP1B3P54709 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1B3P54709 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1B3P54709 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1B3P54709 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1B3P54709 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1B3P54709 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1B3P54709 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1B3P54709 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1B3P54709 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1B3P54709 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1B3P54709 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1B3P54709 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1B3P54709 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1B3P54709 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1B3P54709 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1B3P54709 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1B3P54709 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1B3P54709 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1B3P54709 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1B3P54709 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP1B3P54709 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1B3P54709 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1B3P54709 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1B3P54709 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1B3P54709 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1B3P54709 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1B3P54709 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1B3P54709 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1B3P54709 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1B3P54709 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1B3P54709 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1B3P54709 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1B3P54709 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1B3P54709 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP1B3P54709 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1B3P54709 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1B3P54709 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1B3P54709 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1B3P54709 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1B3P54709 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1B3P54709 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1B3P54709 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms