Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ADGRG1-201ENST00000388813 3925 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 ADGRG1-216ENST00000562631 4042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 ADGRG1-203ENST00000540164 3820 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 ADGRG1-255ENST00000567835 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 ADGRG1-202ENST00000456916 3860 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 ADGRG1-232ENST00000564907 3655 ntTSL 58.66□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 27.5
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PCBP2Q15366 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CDC42SE2-207ENST00000504701 567 ntTSL 420.99■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CDC42SE2-209ENST00000506419 458 ntTSL 313.36□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CDC42SE2-211ENST00000511432 286 ntTSL 54.48□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CDC42SE2-205ENST00000502840 539 ntTSL 43.79□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 LRMDA-201ENST00000372499 899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.615e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 NSFL1C-209ENST00000489203 694 ntTSL 320.53■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 NSFL1C-205ENST00000470376 845 ntTSL 320.3■□□□□ 0.845e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 NSFL1C-212ENST00000555568 863 ntTSL 316.52■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 NSFL1C-210ENST00000553571 752 ntTSL 49.16□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 DPY19L1-205ENST00000463538 461 ntTSL 55.53□□□□□ -1.525e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 DPY19L1-204ENST00000462134 574 ntTSL 45.38□□□□□ -1.555e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 213.7□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 PHF21A-207ENST00000527401 8954 ntTSL 210.29□□□□□ -0.769e-15■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 PHF21A-208ENST00000527753 592 ntTSL 26.69□□□□□ -1.349e-15■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 TRAPPC1-203ENST00000571739 648 ntTSL 38.28□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 TRAPPC1-202ENST00000540486 759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 319.02■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 513.2□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 PDE6D-205ENST00000486044 1005 ntTSL 214.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 PDE6D-203ENST00000428104 627 ntTSL 313.54□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.081e-11■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.292e-9■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-9■■■■■ 27.5
PCBP2Q15366 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-9■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CTNNB1-206ENST00000431914 634 ntTSL 410.48□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CTNNB1-204ENST00000405570 2513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CTNNB1-207ENST00000433400 596 ntTSL 47.35□□□□□ -1.233e-9■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CTNNB1-205ENST00000426215 563 ntTSL 45.32□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.731e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.291e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.183e-12■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.151e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 BRD4-208ENST00000597315 892 ntTSL 525.38■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.641e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 EEF1AKMT2-202ENST00000464099 1013 ntTSL 1 (best)24.18■■□□□ 1.461e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SAP30BP-212ENST00000580322 1558 ntTSL 522.38■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 LRRC1-203ENST00000487251 2527 ntTSL 222.28■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 TBC1D20-203ENST00000461304 2024 ntTSL 1 (best)21.98■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 PRPSAP1-205ENST00000442767 908 ntTSL 521.75■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 MTCH1-204ENST00000460219 1572 ntTSL 221.69■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 PHF23-211ENST00000574899 370 ntTSL 321.64■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SAP30BP-224ENST00000584557 2000 nt21.62■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CREB3L2-206ENST00000468127 596 ntTSL 320.75■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 MEF2A-211ENST00000559903 574 ntTSL 320.53■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 DDX39A-207ENST00000588542 1297 ntTSL 319.23■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 DTNA-217ENST00000590412 604 ntTSL 318.83■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 RIC8A-207ENST00000527468 571 ntTSL 218.7■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SSH1-207ENST00000547862 625 ntTSL 518.66■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 APOO-204ENST00000490078 916 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 DDX39A-204ENST00000586558 1127 ntTSL 218.38■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 27.4
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