RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574899.1

PHF23-211, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-211ENST00000574899 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.78■■■■■ 6.84
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PHF23-211ENST00000574899 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.86■■■■■ 5.41
PHF23-211ENST00000574899 NACADO15069 1562 aa48.64■■■■■ 5.38
PHF23-211ENST00000574899 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.49■■■■■ 5.35
PHF23-211ENST00000574899 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.11■■■■■ 5.29
PHF23-211ENST00000574899 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.01■■■■■ 5.28
PHF23-211ENST00000574899 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.98■■■■■ 5.27
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PHF23-211ENST00000574899 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.71■■■■■ 5.23
PHF23-211ENST00000574899 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.61■■■■■ 5.21
PHF23-211ENST00000574899 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.55■■■■■ 5.2
PHF23-211ENST00000574899 SCRIBQ14160 1630 aa47.15■■■■■ 5.14
PHF23-211ENST00000574899 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.76■■■■■ 5.08
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PHF23-211ENST00000574899 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.27■■■■■ 5
PHF23-211ENST00000574899 CECR2Q9BXF3 1484 aa46■■■■■ 4.95
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PHF23-211ENST00000574899 NCAPD3P42695 1498 aa44.9■■■■■ 4.78
PHF23-211ENST00000574899 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.88■■■■■ 4.78
PHF23-211ENST00000574899 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
PHF23-211ENST00000574899 SMARCA2P51531 1590 aa44.73■■■■■ 4.75
PHF23-211ENST00000574899 HMGXB3Q12766 1538 aa44.63■■■■■ 4.73
PHF23-211ENST00000574899 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.59■■■■■ 4.73
PHF23-211ENST00000574899 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.52■■■■■ 4.72
PHF23-211ENST00000574899 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.7
PHF23-211ENST00000574899 NESP48681 1621 aa44.15■■■■■ 4.66
PHF23-211ENST00000574899 WIZO95785 1651 aa44.12■■■■■ 4.65
PHF23-211ENST00000574899 ERCC6Q03468 1493 aa44.05■■■■■ 4.64
PHF23-211ENST00000574899 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.82■■■■■ 4.61
PHF23-211ENST00000574899 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
PHF23-211ENST00000574899 CUX2O14529 1486 aa43.79■■■■■ 4.6
PHF23-211ENST00000574899 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.63■■■■■ 4.58
PHF23-211ENST00000574899 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
PHF23-211ENST00000574899 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.54■■■■■ 4.56
PHF23-211ENST00000574899 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
PHF23-211ENST00000574899 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.48■■■■■ 4.55
PHF23-211ENST00000574899 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.21■■■■■ 4.51
PHF23-211ENST00000574899 CFTRP13569 1480 aa43.19■■■■■ 4.5
PHF23-211ENST00000574899 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.14■■■■■ 4.5
PHF23-211ENST00000574899 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.09■■■■■ 4.49
PHF23-211ENST00000574899 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.06■■■■■ 4.48
PHF23-211ENST00000574899 WDR62O43379 1518 aa43.05■■■■■ 4.48
PHF23-211ENST00000574899 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.02■■■■■ 4.48
PHF23-211ENST00000574899 PRDM2Q13029 1718 aa42.91■■■■■ 4.46
PHF23-211ENST00000574899 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
PHF23-211ENST00000574899 TOPBP1Q92547 1522 aa42.36■■■■■ 4.37
PHF23-211ENST00000574899 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.24■■■■■ 4.35
PHF23-211ENST00000574899 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
PHF23-211ENST00000574899 ABCC8Q09428 1581 aa42.18■■■■■ 4.34
PHF23-211ENST00000574899 IFT140Q96RY7 1462 aa42.17■■■■■ 4.34
PHF23-211ENST00000574899 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
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PHF23-211ENST00000574899 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
PHF23-211ENST00000574899 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
PHF23-211ENST00000574899 CUX1P39880 1505 aa41.85■■■■■ 4.29
PHF23-211ENST00000574899 OSCARQ8IYS5 282 aa41.85■■■■■ 4.29
PHF23-211ENST00000574899 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.83■■■■■ 4.29
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PHF23-211ENST00000574899 SOGA1O94964 1423 aa41.72■■■■■ 4.27
PHF23-211ENST00000574899 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
PHF23-211ENST00000574899 CHD1O14646 1710 aa41.61■■■■■ 4.25
PHF23-211ENST00000574899 TRIM41Q8WV44 630 aa41.55■■■■■ 4.24
PHF23-211ENST00000574899 WDR97A6NE52 1622 aa41.53■■■■■ 4.24
PHF23-211ENST00000574899 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.41■■■■■ 4.22
PHF23-211ENST00000574899 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.41■■■■■ 4.22
PHF23-211ENST00000574899 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.41■■■■■ 4.22
PHF23-211ENST00000574899 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.4■■■■■ 4.22
PHF23-211ENST00000574899 FBLN2P98095 1184 aa41.35■■■■■ 4.21
PHF23-211ENST00000574899 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.33■■■■■ 4.21
PHF23-211ENST00000574899 SYNJ1O43426 1573 aa41.32■■■■■ 4.2
PHF23-211ENST00000574899 PBRM1Q86U86 1689 aa41.3■■■■■ 4.2
PHF23-211ENST00000574899 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.3■■■■■ 4.2
PHF23-211ENST00000574899 GRIN2BQ13224 1484 aa41.29■■■■■ 4.2
PHF23-211ENST00000574899 TOP2BQ02880 1626 aa41.29■■■■■ 4.2
PHF23-211ENST00000574899 ARHGEF11O15085 1522 aa41.28■■■■■ 4.2
PHF23-211ENST00000574899 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.27■■■■■ 4.2
PHF23-211ENST00000574899 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.26■■■■■ 4.19
PHF23-211ENST00000574899 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.24■■■■■ 4.19
PHF23-211ENST00000574899 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
PHF23-211ENST00000574899 SYNJ2O15056 1496 aa41.11■■■■■ 4.17
PHF23-211ENST00000574899 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
PHF23-211ENST00000574899 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.08■■■■■ 4.17
PHF23-211ENST00000574899 ARAP1Q96P48 1450 aa40.94■■■■■ 4.14
PHF23-211ENST00000574899 ADAMTS12P58397 1594 aa40.9■■■■■ 4.14
PHF23-211ENST00000574899 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.89■■■■■ 4.14
PHF23-211ENST00000574899 GRIN2AQ12879 1464 aa40.8■■■■■ 4.12
PHF23-211ENST00000574899 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.77■■■■■ 4.12
PHF23-211ENST00000574899 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.71■■■■■ 4.11
PHF23-211ENST00000574899 CEP170Q5SW79 1584 aa40.7■■■■■ 4.11
PHF23-211ENST00000574899 NUP160Q12769 1436 aa40.65■■■■■ 4.1
PHF23-211ENST00000574899 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.55■■■■■ 4.08
PHF23-211ENST00000574899 SHROOM2Q13796 1616 aa40.46■■■■■ 4.07
PHF23-211ENST00000574899 KIF27Q86VH2 1401 aa40.4■■■■■ 4.06
PHF23-211ENST00000574899 IGF1RP08069 1367 aa40.39■■■■■ 4.06
PHF23-211ENST00000574899 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.31■■■■■ 4.04
PHF23-211ENST00000574899 CUL7Q14999 1698 aa40.31■■■■■ 4.04
PHF23-211ENST00000574899 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
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