Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.523e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.493e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 218.83■□□□□ 0.611e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.24■□□□□ 0.351e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 216.89■□□□□ 0.291e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 213.66□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 21.2
RBM22Q9NW64 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.492e-7■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 517.49■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 510.81□□□□□ -0.682e-7■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SPCS2-208ENST00000532972 839 ntTSL 218.11■□□□□ 0.493e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.363e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SPCS2-204ENST00000527225 321 ntTSL 517.15■□□□□ 0.343e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.293e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.213e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 HECTD1-213ENST00000556224 3267 ntTSL 513.69□□□□□ -0.223e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.43e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.449e-23■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.543e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.753e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.999e-23■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SPCS2-206ENST00000528265 577 ntTSL 57.2□□□□□ -1.263e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 HECTD1-206ENST00000554471 819 ntTSL 25.71□□□□□ -1.53e-10■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 54.24□□□□□ -1.739e-23■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.121e-8■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-8■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)15.51■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.283e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 PSMD3-202ENST00000415039 1598 ntTSL 222.14■■□□□ 1.134e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SLC25A32-205ENST00000523866 1347 ntTSL 219.62■□□□□ 0.734e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.644e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 316.66■□□□□ 0.264e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.14e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SLC25A32-203ENST00000523256 2711 ntTSL 515.25■□□□□ 0.034e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 SLC25A32-202ENST00000521645 2815 ntTSL 515.12■□□□□ 0.014e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.154e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.294e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.294e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-203ENST00000409258 1408 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.334e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-209ENST00000474969 1431 ntTSL 513.01□□□□□ -0.334e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 PIM2-202ENST00000442430 892 ntTSL 212.96□□□□□ -0.334e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 PSMD3-205ENST00000580980 580 ntTSL 212.21□□□□□ -0.454e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.474e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.514e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RBM39-236ENST00000490484 871 ntTSL 510.36□□□□□ -0.753e-13■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 39.08□□□□□ -0.964e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.024e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 USP48-207ENST00000471752 445 ntTSL 38.06□□□□□ -1.124e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 TRA2B-204ENST00000414862 710 ntTSL 37.37□□□□□ -1.234e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RBM39-239ENST00000494274 704 ntTSL 37.29□□□□□ -1.243e-13■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-211ENST00000490238 699 ntTSL 47□□□□□ -1.294e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 IMMT-205ENST00000419070 2172 ntTSL 56.99□□□□□ -1.294e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 BCLAF1-211ENST00000529917 1336 ntTSL 1 (best)4.45□□□□□ -1.72e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 XPO1-210ENST00000449444 579 ntTSL 44.24□□□□□ -1.734e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 BCLAF1-221ENST00000534762 744 ntTSL 33.94□□□□□ -1.782e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.92e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 XPO1-207ENST00000436018 318 ntTSL 43□□□□□ -1.934e-18■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.954e-9■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RICTOR-207ENST00000511516 7312 ntTSL 1 (best)2.73□□□□□ -1.972e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.022e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 STIL-207ENST00000433827 541 ntTSL 31.26□□□□□ -2.213e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 CABIN1-208ENST00000467937 593 ntTSL 318.78■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 DDX42-204ENST00000577940 1427 ntTSL 58.32□□□□□ -1.083e-7■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 DDX42-218ENST00000584261 510 ntTSL 36.15□□□□□ -1.423e-7■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 DDX42-206ENST00000578137 857 ntTSL 33.72□□□□□ -1.813e-7■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 DDX42-209ENST00000579511 594 ntTSL 53.41□□□□□ -1.863e-7■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 DDX42-205ENST00000577978 581 ntTSL 53.25□□□□□ -1.893e-7■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.761e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 36.2□□□□□ -1.421e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 26.1□□□□□ -1.431e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 54.19□□□□□ -1.741e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 24.11□□□□□ -1.751e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-204ENST00000461653 1702 ntTSL 53.54□□□□□ -1.841e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 53.44□□□□□ -1.861e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 33.26□□□□□ -1.891e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 32.72□□□□□ -1.971e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-211ENST00000489450 586 ntTSL 51.96□□□□□ -2.11e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.131e-12■■■■□ 21.1
RBM22Q9NW64 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.332e-13■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.192e-13■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-13■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.082e-13■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 CDIP1-203ENST00000562579 577 ntTSL 514.34□□□□□ -0.112e-13■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 CDIP1-211ENST00000586768 548 ntTSL 411.83□□□□□ -0.522e-13■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.658e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.568e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.428e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.38e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 08e-7■■■■□ 21
RBM22Q9NW64 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.478e-7■■■■□ 21
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