RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
RABGGTB-205ENST00000462042 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.59■■□□□ 1.69
RABGGTB-205ENST00000462042 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RABGGTB-205ENST00000462042 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXD1Q16676 465 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTB-205ENST00000462042 ADRA2BP18089 450 aa19.68■□□□□ 0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.66■□□□□ 0.74
RABGGTB-205ENST00000462042 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
RABGGTB-205ENST00000462042 MSH5O43196 834 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.51■□□□□ 0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNA4P22459 653 aa18.48■□□□□ 0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
RABGGTB-205ENST00000462042 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.95■□□□□ 0.46
RABGGTB-205ENST00000462042 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RABGGTB-205ENST00000462042 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
RABGGTB-205ENST00000462042 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.61■□□□□ 0.41
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.49■□□□□ 0.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.41■□□□□ 0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.25■□□□□ 0.35
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.98■□□□□ 0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB22O15209 634 aa16.96■□□□□ 0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC4A2P04920 1241 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTB-205ENST00000462042 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGGTB-205ENST00000462042 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RABGGTB-205ENST00000462042 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.233e-7■■□□□ 13.1
RABGGTB-205ENST00000462042 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.42■□□□□ 0.22
RABGGTB-205ENST00000462042 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
RABGGTB-205ENST00000462042 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTB-205ENST00000462042 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
RABGGTB-205ENST00000462042 APLP2Q06481 763 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTB-205ENST00000462042 POTEDQ86YR6 584 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTB-205ENST00000462042 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF39Q9H2S5 420 aa15.87■□□□□ 0.13
RABGGTB-205ENST00000462042 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGGTB-205ENST00000462042 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTB-205ENST00000462042 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTB-205ENST00000462042 CAPN15O75808 1086 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTB-205ENST00000462042 FKBP8Q14318 412 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTB-205ENST00000462042 POLA2Q14181 598 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGGTB-205ENST00000462042 FBLN2P98095 1184 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RABGGTB-205ENST00000462042 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCB7O75027 752 aa15.27■□□□□ 0.04
RABGGTB-205ENST00000462042 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGGTB-205ENST00000462042 DSG3P32926 999 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGGTB-205ENST00000462042 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO3Q9UK99 471 aa15.05■□□□□ -0
RABGGTB-205ENST00000462042 PROM2Q8N271 834 aa15.04■□□□□ -0
RABGGTB-205ENST00000462042 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RABGGTB-205ENST00000462042 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SPDYE6P0CI01 402 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTB-205ENST00000462042 OSCARQ8IYS5 282 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTB-205ENST00000462042 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTB-205ENST00000462042 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RABGGTB-205ENST00000462042 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTB-205ENST00000462042 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGGTB-205ENST00000462042 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTB-205ENST00000462042 AKT1S1Q96B36 256 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTB-205ENST00000462042 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGGTB-205ENST00000462042 KLHL34Q8N239 644 aa14.42□□□□□ -0.1
RABGGTB-205ENST00000462042 PLEKHG5O94827 1062 aa14.41□□□□□ -0.1
RABGGTB-205ENST00000462042 MIER1Q8N108 512 aa14.4□□□□□ -0.1
RABGGTB-205ENST00000462042 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
RABGGTB-205ENST00000462042 SPOCK2Q92563 424 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
RABGGTB-205ENST00000462042 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.23□□□□□ -0.13
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR29P0C7W0 189 aa14.2□□□□□ -0.14
RABGGTB-205ENST00000462042 PKD2Q13563 968 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC24A1O60721 1099 aa14.14□□□□□ -0.15
RABGGTB-205ENST00000462042 PITPNM1O00562 1244 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-205ENST00000462042 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
RABGGTB-205ENST00000462042 CREBZFQ9NS37 354 aa14.06□□□□□ -0.16
RABGGTB-205ENST00000462042 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.05□□□□□ -0.16
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM41Q8WV44 630 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGGTB-205ENST00000462042 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
RABGGTB-205ENST00000462042 GSE1Q14687 1217 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGGTB-205ENST00000462042 NUBP1P53384 320 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGGTB-205ENST00000462042 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.95□□□□□ -0.18
RABGGTB-205ENST00000462042 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM212AQ96EL1 285 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGGTB-205ENST00000462042 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGGTB-205ENST00000462042 RGL2O15211 777 aa13.88□□□□□ -0.19
RABGGTB-205ENST00000462042 PLCB2Q00722 1185 aa13.82□□□□□ -0.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.8□□□□□ -0.2
RABGGTB-205ENST00000462042 RASEFQ8IZ41 740 aa13.79□□□□□ -0.2
RABGGTB-205ENST00000462042 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CHADLQ6NUI6 762 aa13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms