RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
RABGGTB-202ENST00000370826 CHIC1Q5VXU3 224 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTB-202ENST00000370826 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXD1Q16676 465 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGGTB-202ENST00000370826 MSH5O43196 834 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTB-202ENST00000370826 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTB-202ENST00000370826 POTEDQ86YR6 584 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTB-202ENST00000370826 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.72■□□□□ 0.11
RABGGTB-202ENST00000370826 ADRA2BP18089 450 aa15.7■□□□□ 0.1
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGGTB-202ENST00000370826 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGGTB-202ENST00000370826 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGGTB-202ENST00000370826 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNA4P22459 653 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGGTB-202ENST00000370826 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGGTB-202ENST00000370826 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.69□□□□□ -0.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF39Q9H2S5 420 aa13.59□□□□□ -0.23
RABGGTB-202ENST00000370826 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
RABGGTB-202ENST00000370826 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.25□□□□□ -0.29
RABGGTB-202ENST00000370826 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 13.1
RABGGTB-202ENST00000370826 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGGTB-202ENST00000370826 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGGTB-202ENST00000370826 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB22O15209 634 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC4A2P04920 1241 aa12.78□□□□□ -0.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CAPN15O75808 1086 aa12.77□□□□□ -0.37
RABGGTB-202ENST00000370826 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGGTB-202ENST00000370826 DSG3P32926 999 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGGTB-202ENST00000370826 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGGTB-202ENST00000370826 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGGTB-202ENST00000370826 APLP2Q06481 763 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCB7O75027 752 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGGTB-202ENST00000370826 POTEHQ6S545 545 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGGTB-202ENST00000370826 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-202ENST00000370826 ATXN8OSP0DMR3 200 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-202ENST00000370826 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
RABGGTB-202ENST00000370826 POLA2Q14181 598 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
RABGGTB-202ENST00000370826 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
RABGGTB-202ENST00000370826 AKT1S1Q96B36 256 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGGTB-202ENST00000370826 OSCARQ8IYS5 282 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGGTB-202ENST00000370826 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-202ENST00000370826 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-202ENST00000370826 FBLN2P98095 1184 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-202ENST00000370826 FKBP8Q14318 412 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PITPNM1O00562 1244 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-202ENST00000370826 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-202ENST00000370826 HAX1O00165 279 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGGTB-202ENST00000370826 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDYE6P0CI01 402 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGGTB-202ENST00000370826 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-202ENST00000370826 PROM2Q8N271 834 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
RABGGTB-202ENST00000370826 EVX2Q03828 476 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGGTB-202ENST00000370826 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-202ENST00000370826 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO3Q9UK99 471 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-202ENST00000370826 CHADLQ6NUI6 762 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-202ENST00000370826 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR29P0C7W0 189 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-202ENST00000370826 GABBR2O75899 941 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGGTB-202ENST00000370826 STAG3Q9UJ98 1225 aa11□□□□□ -0.65
RABGGTB-202ENST00000370826 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-202ENST00000370826 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
RABGGTB-202ENST00000370826 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
RABGGTB-202ENST00000370826 LHX8Q68G74 356 aa10.86□□□□□ -0.67
RABGGTB-202ENST00000370826 MIER1Q8N108 512 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGGTB-202ENST00000370826 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.84□□□□□ -0.67
RABGGTB-202ENST00000370826 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
RABGGTB-202ENST00000370826 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-202ENST00000370826 POTEIP0CG38 1075 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL34Q8N239 644 aa10.77□□□□□ -0.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHG5O94827 1062 aa10.75□□□□□ -0.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CREBZFQ9NS37 354 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.74□□□□□ -0.69
RABGGTB-202ENST00000370826 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CLCN6P51797 869 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-202ENST00000370826 SPOCK2Q92563 424 aa10.71□□□□□ -0.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms