RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RABGGTB-212ENST00000491266 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTB-212ENST00000491266 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
RABGGTB-212ENST00000491266 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
RABGGTB-212ENST00000491266 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.83■□□□□ 0.44
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RABGGTB-212ENST00000491266 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.75■□□□□ 0.11
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RABGGTB-212ENST00000491266 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
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RABGGTB-212ENST00000491266 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.95□□□□□ -0.02
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RABGGTB-212ENST00000491266 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTB-212ENST00000491266 ZBTB22O15209 634 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTB-212ENST00000491266 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.39□□□□□ -0.11
RABGGTB-212ENST00000491266 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.37□□□□□ -0.11
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC4A2P04920 1241 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGGTB-212ENST00000491266 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.12□□□□□ -0.15
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RABGGTB-212ENST00000491266 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.97□□□□□ -0.173e-7■■□□□ 13.1
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RABGGTB-212ENST00000491266 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGGTB-212ENST00000491266 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RABGGTB-212ENST00000491266 RNF39Q9H2S5 420 aa13.59□□□□□ -0.23
RABGGTB-212ENST00000491266 APLP2Q06481 763 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGGTB-212ENST00000491266 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
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RABGGTB-212ENST00000491266 CAPN15O75808 1086 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-212ENST00000491266 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
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RABGGTB-212ENST00000491266 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
RABGGTB-212ENST00000491266 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGGTB-212ENST00000491266 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGGTB-212ENST00000491266 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP12.44□□□□□ -0.42
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RABGGTB-212ENST00000491266 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.36□□□□□ -0.43
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RABGGTB-212ENST00000491266 AKT1S1Q96B36 256 aa12.31□□□□□ -0.44
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RABGGTB-212ENST00000491266 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGGTB-212ENST00000491266 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.14□□□□□ -0.47
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RABGGTB-212ENST00000491266 SPOCK2Q92563 424 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGGTB-212ENST00000491266 KLHL34Q8N239 644 aa12.08□□□□□ -0.48
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RABGGTB-212ENST00000491266 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGGTB-212ENST00000491266 PITPNM1O00562 1244 aa12.04□□□□□ -0.48
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RABGGTB-212ENST00000491266 PLEKHG5O94827 1062 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR29P0C7W0 189 aa12□□□□□ -0.49
RABGGTB-212ENST00000491266 CREBZFQ9NS37 354 aa12□□□□□ -0.49
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RABGGTB-212ENST00000491266 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.89□□□□□ -0.51
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RABGGTB-212ENST00000491266 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIM41Q8WV44 630 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-212ENST00000491266 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-212ENST00000491266 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-212ENST00000491266 GSE1Q14687 1217 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-212ENST00000491266 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-212ENST00000491266 MYO15BQ96JP2 1530 aa11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC24A1O60721 1099 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGGTB-212ENST00000491266 RGL2O15211 777 aa11.76□□□□□ -0.53
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