Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 214.54□□□□□ -0.087e-7■■■■■ 135.9
SF3B1O75533 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 135.9
SF3B1O75533 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 135.9
SF3B1O75533 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.247e-7■■■■■ 135.9
SF3B1O75533 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 135.9
SF3B1O75533 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 135.9
SF3B1O75533 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 135.9
SF3B1O75533 ERI3-205ENST00000457571 975 ntTSL 527.57■■■□□ 24e-8■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 517.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.472e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 RPL14-204ENST00000435633 966 ntTSL 223.65■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 MXD1-202ENST00000409442 982 ntTSL 223.46■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 GATS-211ENST00000543273 2840 ntTSL 1 (best)23.17■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 LPCAT1-206ENST00000514484 756 ntTSL 320.69■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 220.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 CCND3-217ENST00000512381 432 ntTSL 319.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 GATS-201ENST00000328453 3526 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 518■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 FCHO2-204ENST00000507345 726 ntTSL 516.15■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 MAPKAP1-216ENST00000473837 1032 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 RPL14-208ENST00000479563 794 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-207ENST00000482136 546 ntTSL 311.6□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 DENND1A-207ENST00000474676 603 ntTSL 510.58□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-210ENST00000544404 2379 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-202ENST00000354807 1152 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-203ENST00000414869 2357 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-209ENST00000498791 559 ntTSL 39.56□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-205ENST00000469520 2737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-201ENST00000322067 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-204ENST00000463953 644 ntTSL 38.3□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-206ENST00000480959 583 ntTSL 47.32□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 RPL14-209ENST00000481798 604 ntTSL 36.64□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 BPNT1-208ENST00000498237 569 ntTSL 35.99□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 TM9SF2-202ENST00000463709 727 ntTSL 33.2□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 ACER3-203ENST00000525325 560 ntTSL 32.07□□□□□ -2.082e-7■■■■■ 135.8
SF3B1O75533 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 135.7
SF3B1O75533 CNST-204ENST00000483271 2767 ntTSL 216.46■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 135.7
SF3B1O75533 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 135.7
SF3B1O75533 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 135.7
SF3B1O75533 CNST-201ENST00000366511 645 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 135.7
SF3B1O75533 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 135.6
SF3B1O75533 SDCCAG8-202ENST00000435549 1551 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 135.6
SF3B1O75533 EPS15L1-209ENST00000596037 629 ntTSL 313.03□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 135.6
SF3B1O75533 EPS15L1-205ENST00000593760 583 ntTSL 412.37□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 135.6
SF3B1O75533 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 135.6
SF3B1O75533 MAP2K7-205ENST00000468058 1589 ntTSL 227.68■■■□□ 2.021e-8■■■■■ 135.5
SF3B1O75533 PKP3-206ENST00000528036 940 ntTSL 225.45■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 135.5
SF3B1O75533 PKP3-210ENST00000533249 1111 ntTSL 325.25■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 135.5
SF3B1O75533 PKP3-211ENST00000534401 756 ntTSL 323.27■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 135.5
SF3B1O75533 PKP3-205ENST00000527442 847 ntTSL 322.82■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 135.5
SF3B1O75533 PKP3-208ENST00000531857 687 ntTSL 419.18■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 135.5
SF3B1O75533 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 135.5
SF3B1O75533 PKP3-209ENST00000533069 590 ntTSL 218.24■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 135.5
SF3B1O75533 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 135.5
SF3B1O75533 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 135.4
SF3B1O75533 RPF2-202ENST00000425871 906 ntTSL 512.37□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 135.4
SF3B1O75533 RPF2-203ENST00000441448 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 135.4
SF3B1O75533 RPF2-201ENST00000368864 873 ntTSL 57.27□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 135.4
SF3B1O75533 RPF2-204ENST00000607388 3621 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 135.4
SF3B1O75533 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 216.13■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 135.3
SF3B1O75533 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 135.3
SF3B1O75533 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 135.3
SF3B1O75533 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 510.31□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 135.2
SF3B1O75533 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.31□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 135.2
SF3B1O75533 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 52.76□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 135.2
SF3B1O75533 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 52.54□□□□□ -23e-6■■■■■ 135.2
SF3B1O75533 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 C9orf3-208ENST00000451893 514 ntTSL 323.79■■□□□ 1.44e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 PPP2R3B-208ENST00000479438 1090 ntTSL 222.78■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 NCBP1-203ENST00000478100 892 ntTSL 320.18■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 PPP2R3B-206ENST00000477110 5802 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 EBP-203ENST00000446158 714 ntTSL 518.75■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 EBP-201ENST00000276096 904 ntTSL 217.95■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 EBP-206ENST00000498425 796 ntTSL 316.26■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 TMEM44-209ENST00000452358 846 ntTSL 315.66■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 135.1
SF3B1O75533 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 135.1
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1277.9 ms