RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493112.5

SUCLG2-204, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-204ENST00000493112 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.91■■■□□ 2.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.69■■■□□ 2.02
SUCLG2-204ENST00000493112 ABCC9O60706 1549 aa27.3■■□□□ 1.96
SUCLG2-204ENST00000493112 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.15■■□□□ 1.78
SUCLG2-204ENST00000493112 NACADO15069 1562 aa26.02■■□□□ 1.76
SUCLG2-204ENST00000493112 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.83■■□□□ 1.73
SUCLG2-204ENST00000493112 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.74■■□□□ 1.71
SUCLG2-204ENST00000493112 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SUCLG2-204ENST00000493112 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.69■■□□□ 1.7
SUCLG2-204ENST00000493112 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.55■■□□□ 1.68
SUCLG2-204ENST00000493112 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.4■■□□□ 1.66
SUCLG2-204ENST00000493112 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
SUCLG2-204ENST00000493112 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2-204ENST00000493112 SCRIBQ14160 1630 aa25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2-204ENST00000493112 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.05■■□□□ 1.6
SUCLG2-204ENST00000493112 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.72■■□□□ 1.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.54■■□□□ 1.52
SUCLG2-204ENST00000493112 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SUCLG2-204ENST00000493112 SMARCA4P51532 1647 aa24.1■■□□□ 1.45
SUCLG2-204ENST00000493112 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SUCLG2-204ENST00000493112 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.98■■□□□ 1.43
SUCLG2-204ENST00000493112 NCAPD3P42695 1498 aa23.97■■□□□ 1.43
SUCLG2-204ENST00000493112 SMARCA2P51531 1590 aa23.95■■□□□ 1.42
SUCLG2-204ENST00000493112 HMGXB3Q12766 1538 aa23.9■■□□□ 1.42
SUCLG2-204ENST00000493112 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.84■■□□□ 1.41
SUCLG2-204ENST00000493112 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.84■■□□□ 1.41
SUCLG2-204ENST00000493112 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
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SUCLG2-204ENST00000493112 NESP48681 1621 aa23.56■■□□□ 1.36
SUCLG2-204ENST00000493112 ERCC6Q03468 1493 aa23.54■■□□□ 1.36
SUCLG2-204ENST00000493112 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.44■■□□□ 1.34
SUCLG2-204ENST00000493112 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SUCLG2-204ENST00000493112 CUX2O14529 1486 aa23.39■■□□□ 1.33
SUCLG2-204ENST00000493112 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.36■■□□□ 1.33
SUCLG2-204ENST00000493112 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SUCLG2-204ENST00000493112 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SUCLG2-204ENST00000493112 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.24■■□□□ 1.31
SUCLG2-204ENST00000493112 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.22■■□□□ 1.31
SUCLG2-204ENST00000493112 CFTRP13569 1480 aa23.08■■□□□ 1.29
SUCLG2-204ENST00000493112 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.06■■□□□ 1.28
SUCLG2-204ENST00000493112 PRDM2Q13029 1718 aa23.05■■□□□ 1.28
SUCLG2-204ENST00000493112 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.04■■□□□ 1.28
SUCLG2-204ENST00000493112 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.03■■□□□ 1.28
SUCLG2-204ENST00000493112 WDR62O43379 1518 aa23.03■■□□□ 1.28
SUCLG2-204ENST00000493112 CCDC88BA6NC98 1476 aa23■■□□□ 1.27
SUCLG2-204ENST00000493112 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.92■■□□□ 1.26
SUCLG2-204ENST00000493112 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.91■■□□□ 1.26
SUCLG2-204ENST00000493112 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SUCLG2-204ENST00000493112 TOPBP1Q92547 1522 aa22.65■■□□□ 1.22
SUCLG2-204ENST00000493112 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.62■■□□□ 1.21
SUCLG2-204ENST00000493112 ABCC8Q09428 1581 aa22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2-204ENST00000493112 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2-204ENST00000493112 IFT140Q96RY7 1462 aa22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SUCLG2-204ENST00000493112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SUCLG2-204ENST00000493112 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SUCLG2-204ENST00000493112 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SUCLG2-204ENST00000493112 CUX1P39880 1505 aa22.39■■□□□ 1.17
SUCLG2-204ENST00000493112 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.35■■□□□ 1.17
SUCLG2-204ENST00000493112 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.34■■□□□ 1.17
SUCLG2-204ENST00000493112 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
SUCLG2-204ENST00000493112 CHD1O14646 1710 aa22.28■■□□□ 1.16
SUCLG2-204ENST00000493112 WDR97A6NE52 1622 aa22.28■■□□□ 1.16
SUCLG2-204ENST00000493112 SOGA1O94964 1423 aa22.27■■□□□ 1.16
SUCLG2-204ENST00000493112 OSCARQ8IYS5 282 aa22.26■■□□□ 1.15
SUCLG2-204ENST00000493112 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUCLG2-204ENST00000493112 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.17■■□□□ 1.14
SUCLG2-204ENST00000493112 PBRM1Q86U86 1689 aa22.15■■□□□ 1.14
SUCLG2-204ENST00000493112 SYNJ1O43426 1573 aa22.14■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 TOP2BQ02880 1626 aa22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 GRIN2BQ13224 1484 aa22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 TRIM41Q8WV44 630 aa22.08■■□□□ 1.13
SUCLG2-204ENST00000493112 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SUCLG2-204ENST00000493112 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2-204ENST00000493112 ARHGEF11O15085 1522 aa22.05■■□□□ 1.12
SUCLG2-204ENST00000493112 FBLN2P98095 1184 aa22.04■■□□□ 1.12
SUCLG2-204ENST00000493112 SYNJ2O15056 1496 aa21.98■■□□□ 1.11
SUCLG2-204ENST00000493112 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.96■■□□□ 1.11
SUCLG2-204ENST00000493112 ADAMTS12P58397 1594 aa21.92■■□□□ 1.1
SUCLG2-204ENST00000493112 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SUCLG2-204ENST00000493112 ARAP1Q96P48 1450 aa21.85■■□□□ 1.09
SUCLG2-204ENST00000493112 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.83■■□□□ 1.09
SUCLG2-204ENST00000493112 GRIN2AQ12879 1464 aa21.83■■□□□ 1.08
SUCLG2-204ENST00000493112 CEP170Q5SW79 1584 aa21.77■■□□□ 1.08
SUCLG2-204ENST00000493112 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.77■■□□□ 1.08
SUCLG2-204ENST00000493112 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.75■■□□□ 1.07
SUCLG2-204ENST00000493112 NUP160Q12769 1436 aa21.72■■□□□ 1.07
SUCLG2-204ENST00000493112 SHROOM2Q13796 1616 aa21.66■■□□□ 1.06
SUCLG2-204ENST00000493112 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.65■■□□□ 1.06
SUCLG2-204ENST00000493112 KIF27Q86VH2 1401 aa21.63■■□□□ 1.05
SUCLG2-204ENST00000493112 CUL7Q14999 1698 aa21.63■■□□□ 1.05
SUCLG2-204ENST00000493112 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.61■■□□□ 1.05
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