Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC2Q9BYS8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC2Q9BYS8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms