Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ELLP55199 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELLP55199 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms