Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLKQ9UBE8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLKQ9UBE8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLKQ9UBE8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLKQ9UBE8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms