Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTRQ99707 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTRQ99707 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTRQ99707 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTRQ99707 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MTRQ99707 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTRQ99707 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTRQ99707 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTRQ99707 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTRQ99707 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTRQ99707 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTRQ99707 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTRQ99707 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MTRQ99707 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MTRQ99707 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MTRQ99707 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTRQ99707 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTRQ99707 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTRQ99707 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTRQ99707 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTRQ99707 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTRQ99707 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTRQ99707 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTRQ99707 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTRQ99707 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTRQ99707 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTRQ99707 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTRQ99707 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTRQ99707 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTRQ99707 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTRQ99707 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MTRQ99707 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTRQ99707 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTRQ99707 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTRQ99707 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTRQ99707 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTRQ99707 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTRQ99707 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTRQ99707 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTRQ99707 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTRQ99707 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MTRQ99707 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTRQ99707 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTRQ99707 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTRQ99707 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTRQ99707 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTRQ99707 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTRQ99707 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTRQ99707 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MTRQ99707 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTRQ99707 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTRQ99707 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTRQ99707 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTRQ99707 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTRQ99707 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTRQ99707 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTRQ99707 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTRQ99707 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTRQ99707 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTRQ99707 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTRQ99707 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTRQ99707 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTRQ99707 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTRQ99707 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTRQ99707 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTRQ99707 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTRQ99707 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTRQ99707 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTRQ99707 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MTRQ99707 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTRQ99707 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTRQ99707 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTRQ99707 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTRQ99707 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTRQ99707 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTRQ99707 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MTRQ99707 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTRQ99707 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTRQ99707 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTRQ99707 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTRQ99707 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTRQ99707 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTRQ99707 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTRQ99707 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTRQ99707 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTRQ99707 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTRQ99707 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTRQ99707 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTRQ99707 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTRQ99707 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTRQ99707 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTRQ99707 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTRQ99707 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTRQ99707 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTRQ99707 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTRQ99707 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTRQ99707 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTRQ99707 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTRQ99707 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTRQ99707 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms