Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDH12Q96NR8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH12Q96NR8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH12Q96NR8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH12Q96NR8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms