Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLCD1Q96CP7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLCD1Q96CP7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLCD1Q96CP7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLCD1Q96CP7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLCD1Q96CP7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms