Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TLCD1Q96CP7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TLCD1Q96CP7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TLCD1Q96CP7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TLCD1Q96CP7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TLCD1Q96CP7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TLCD1Q96CP7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TLCD1Q96CP7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TLCD1Q96CP7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TLCD1Q96CP7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TLCD1Q96CP7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TLCD1Q96CP7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TLCD1Q96CP7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TLCD1Q96CP7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TLCD1Q96CP7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TLCD1Q96CP7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TLCD1Q96CP7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TLCD1Q96CP7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TLCD1Q96CP7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TLCD1Q96CP7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TLCD1Q96CP7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TLCD1Q96CP7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TLCD1Q96CP7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TLCD1Q96CP7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TLCD1Q96CP7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TLCD1Q96CP7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TLCD1Q96CP7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TLCD1Q96CP7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TLCD1Q96CP7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TLCD1Q96CP7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TLCD1Q96CP7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TLCD1Q96CP7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TLCD1Q96CP7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TLCD1Q96CP7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TLCD1Q96CP7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TLCD1Q96CP7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TLCD1Q96CP7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TLCD1Q96CP7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TLCD1Q96CP7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TLCD1Q96CP7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TLCD1Q96CP7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TLCD1Q96CP7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TLCD1Q96CP7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TLCD1Q96CP7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TLCD1Q96CP7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TLCD1Q96CP7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TLCD1Q96CP7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TLCD1Q96CP7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TLCD1Q96CP7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TLCD1Q96CP7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TLCD1Q96CP7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TLCD1Q96CP7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TLCD1Q96CP7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TLCD1Q96CP7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TLCD1Q96CP7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TLCD1Q96CP7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TLCD1Q96CP7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TLCD1Q96CP7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TLCD1Q96CP7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TLCD1Q96CP7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TLCD1Q96CP7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TLCD1Q96CP7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TLCD1Q96CP7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TLCD1Q96CP7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TLCD1Q96CP7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TLCD1Q96CP7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TLCD1Q96CP7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TLCD1Q96CP7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TLCD1Q96CP7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TLCD1Q96CP7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TLCD1Q96CP7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TLCD1Q96CP7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TLCD1Q96CP7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TLCD1Q96CP7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TLCD1Q96CP7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TLCD1Q96CP7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TLCD1Q96CP7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TLCD1Q96CP7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TLCD1Q96CP7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TLCD1Q96CP7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TLCD1Q96CP7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TLCD1Q96CP7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TLCD1Q96CP7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TLCD1Q96CP7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TLCD1Q96CP7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TLCD1Q96CP7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TLCD1Q96CP7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TLCD1Q96CP7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TLCD1Q96CP7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TLCD1Q96CP7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TLCD1Q96CP7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TLCD1Q96CP7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TLCD1Q96CP7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TLCD1Q96CP7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TLCD1Q96CP7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TLCD1Q96CP7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TLCD1Q96CP7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TLCD1Q96CP7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TLCD1Q96CP7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TLCD1Q96CP7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms