Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXO27Q8NI29 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO27Q8NI29 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO27Q8NI29 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms