Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEH6

MNS1, Meiosis-specific nuclear structural protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNS1Q8NEH6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MNS1Q8NEH6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MNS1Q8NEH6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MNS1Q8NEH6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MNS1Q8NEH6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MNS1Q8NEH6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MNS1Q8NEH6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MNS1Q8NEH6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MNS1Q8NEH6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MNS1Q8NEH6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms