Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD12Q8N8I0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD12Q8N8I0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD12Q8N8I0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD12Q8N8I0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD12Q8N8I0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD12Q8N8I0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SAMD12Q8N8I0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SAMD12Q8N8I0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms